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今いまや世よの中なかの出来事できごとはすべてプログラム化かされており、″プロミン″と呼よばれる不思議ふしぎなモンスターのおかげでこの世よの中なかの仕組しくみは動うごいていた！実じつは身みの回まわりで起おこる不具合ふぐあい（バグ）は、プロミンがバグ化かした″バグミン″の仕業しわざだったのだ！このままバグミンを放ほおっておけば、いつか大事おおごとになるかもしれない…
少年しょうねんユートは突然とつぜん現あられた宇宙犬うちゅうけんワンダと出会であいい、カメラ型がたをはじめ様々さまざまなキーアイテムを駆使くしして様々さまざまなバグミンの捕獲ほかくに乗のり出だす！
プロミンはそれぞれ、「モノを加速かそくさせる」「炎ほのおを出だす」「モノを作つくり出だす」など、″カミワザ″と言いわれる特別とくべつな能力のうりょくをもっており、迫せまり来くるバグミンに″カミワザ″を繰くり出だして対抗たいこうする！
最初さいしょは身みの回まわりのイタズラ程度ていどだったバグミンによる被害ひがいも、どんどん大おおきくなってやがて地球規模ちきゅうきぼに…
果はたして1人ひとりと1匹いっぴきは地球ちきゅうを救すくう事ことが出来できるのか！？